Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms