Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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