Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms