Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DDX39BQ13838 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DDX39BQ13838 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DDX39BQ13838 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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