Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMC2Q13753 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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