Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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