Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CAMK2BQ13554 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms