Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms