Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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