Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRAF1Q13077 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF1Q13077 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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