Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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