Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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KCNH2Q12809 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNH2Q12809 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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