Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SYCNQ0VAF6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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