Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms