Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms