Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms