Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREMQ03060 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREMQ03060 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CREMQ03060 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms