Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms