Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms