Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP2C1P98194 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms