Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms