Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms