Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIMK2P53671 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms