Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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