Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNA2P51530 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms