Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms