Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPIAP49247 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RPIAP49247 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RPIAP49247 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RPIAP49247 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPIAP49247 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms