Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms