Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRXP46100 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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