Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD2P43304 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms