Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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