Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms