Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP1P29466 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms