Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBL1P28749 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms