Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms