Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLD1P28340 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms