Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms