Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTSSP25774 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms