Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms