Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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