Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRBP23467 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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