Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2B1P20020 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms