Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXB4P17483 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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