Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BMP3P12645 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BMP3P12645 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BMP3P12645 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BMP3P12645 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms