Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA4P06727 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms