Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1AO95602 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms