Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX6O95503 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms