Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms