Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TIMM17BO60830 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms