Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms